離子色譜儀是高效液相色譜儀的一種，主要用于環境樣品的分析。離子色譜儀在使用過程中有較多注意事項，掌握這些注意事項有利于減少檢測誤差和儀器故障。
1.平時需要防止細菌滋生
(1)再生液、淋洗液以及沖洗液應當保持新鮮，定期更換，建議每次使用時都使用現配置的試劑；
(2)如果仍有細菌滋生，可在淋洗液中加人5%的丙酮或甲醇；
(3)建議所有容器用水沖洗后再用丙酮/水(1:4)或甲醇/水( 1:4)沖洗。
2.避免顆粒進入管路
(1)使用“在線過濾器”、“淋洗液過濾頭”和保護柱”；
(2)再生液.淋洗液所用溶劑均利用抽濾裝置經0.45um微孔濾膜過濾。
3.水質要求電阻大于18mω，并用小于0.45mm微孔濾膜過濾使其無顆粒。
4.所有試劑都須是分析純以上，標準樣品需要是離子色譜的。
5.淋洗液
(1)在使用前應先過濾、脫氣，以盡可能排除顆粒物及氣泡的干擾；
(2)先充分潤洗淋洗液瓶后再添加淋洗液；
(3)淋洗液有效期一般不可超過一周，夏天容易長菌需要每天更換；
(4)淋洗液在使用時應加裝二氧化碳吸收管。二氧化碳吸收管里應只裝半管的粒狀氧化鈣，兩端用脫脂棉封住即可，千萬不可裝得過滿，否則可能引起漲爆。
6.分離柱
(1)分離柱壓力不能 12 mpa，否則需更換柱子；
(2)陰離子柱ph范圍一般為3-1；
(3)短時間不用時可將柱子卸下，將兩端蓋上塞子后，放入盒中保存；
(4)若陰離子柱超過1個月以上不使用，用甲醇：水=1:4沖洗管路后保存到10 mmol/l 碳酸鈉中，陽離子柱則應在冰箱內冷藏保存(4℃)；
(5)重新將柱子接入系統時，需先用新配置的淋洗液沖洗10min以上管路后再接電導檢測器。
7.抑制器
(1)不能用手接觸抑制器的陶瓷片；
(2)抑制器不可在未通液體的情況下空轉，否則會加大對桂芯陶瓷片的磨損；
(3)抑制器的壓力應小于0.3 mpa；
(4)長時間走基線時定時切換抑制柱。